Jan de Winne enseigne le traverso, la musique de chambre et l’étude des traités au Conservatoire National Supérieur de Paris ainsi qu’à celui de Bruxelles.  

Il s’est spécialisé en flûte baroque auprès de Barthold Kuijken, après l’obtention de ses diplômes de musicologue et d’historien de l’art à l’université de Gand.  
Il a prêté son concours aux plus grands ensembles de musique ancienne (dont Il Fondamento, Salzburger Barockorchester, Amsterdam Baroque Orchestra) pour s’attacher aux formations dont Philippe Herreweghe assure la direction, avant de fonder Il Gardellino, ensemble de musique de chambre avec lequel il publie des enregistrements consacrés aux cantates de Telemann, trios avec pianoforte de J. Haydn, concertos de Boismoirtier, quatuors de CPE Bach, etc.  

Son activité de facture de flûtes baroques et classiques fait de lui un musicien très informé sur toutes les facettes de la pratique instrumentale, d’hier et d’aujourd’hui !